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基因芯片技术服务 small rna修饰芯片 m6a单碱基分辨率芯片 mrna&lncrna表观转录组芯片 circrna表观转录组芯片 |
ngs测序技术服务 rna m6a甲基化测序（merip seq） |
lc-ms mrna碱基修饰检测 trna碱基修饰检测 |
pcr技术服务 m6a绝对定量rt-pcr技术服务 m6a单碱基位点pcr（mazf酶切法）技术服务 |
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基因芯片技术服务 dna甲基化芯片 dna羟甲基化芯片 chip-chip |
ngs测序技术服务 dna甲酰基胞嘧啶(5fc)修饰测序 dna 5hmc 测序（化学法） dna甲基化测序 dna羟甲基化测序 染色质免疫共沉淀测序 |
pcr技术服务 medip-qpcr hmedip-qpcr chip-qpcr |
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蛋白相对定量 tmt标记定量技术 非标定量技术 |
蛋白修饰 tmt标记定量磷酸化 非标定量磷酸化 |
rna/蛋白-蛋白相互作用 rna-蛋白相互作用 蛋白-蛋白相互作用 |
lncrna芯片结果包含基本数据分析有哪些？深入数据分析有哪些？
基本数据分析：差异表达mrna及lncrna；分层聚类，scatter plot(散点图)，volcano plot；差异表达mrna的go和pathway分析；特色lncrna子类分析。
深入数据分析：cnc分析；cerna分析；趋势（stem）分析；lncrna-gsea分析；差异高保守lncrna、差异组织特异性lncrna、差异生物学过程相关lncrna、差异疾病相关lncrna分析（仅针对human lncrna芯片 v4.0）。
为什么lncrna芯片报告中有重复行？
lncrna有重复行是因为报告中会注释lncrna的临近基因转录本，而当一个lncrna有多个临近基因转录本，在报告中的具体表现就是出现多行，而每一行的区别就是注释的associated_gene_acc名称不同。
我想在购买芯片服务之前看看感兴趣的lncrna是否在芯片上。贵公司是否可以提供芯片上所有lncrna探针的详细序列列表？
是否每个lncrna都有polya 尾巴？数据库里是否是全长序列，是否一定要做race?
约75%的lncrna具有polya尾巴，其余的没有。“source”为refseq、ucsc或gencode数据库的lncrna是经过充分验证确定的lncrna，不用做race，更建议选用。“source”为其他数据库的lncrna需要race获取详细的序列信息。
arraystar lncrna芯片探针设计如何做到转录本特异性？有什么优势？
同一个基因转录的不同转录本都设计有单独的检测探针，这些探针设计在不同转录本特异的区域，如外显子剪接拼接位点。能够实现对不同转录本的准确、特异性检测，这对分析lncrna功能极为关键。
