arraystar m6a单碱基分辨率芯片利用rna酶mazf对m6a敏感的特性，可在单碱基分辨率水平定位m6a位点，并对其进行定量。该芯片具有其它现存技术难以企及的优势，是研究m6a动态变化、生物学功能以及疾病相关性的强大工具。arraystar m6a 单碱基分辨率芯片技术拥有以下多种传统m6a-seq分析技术所不具备的优点：
• 一种检测m6a的正交实验方法：与以m6a抗体免疫共沉淀为基础的merip或miclip等技术不同，芯片提供了一种不依赖于抗体的m6a系统性检测方法。
• 单碱基分辨率水平定位m6a位点：merip-seq技术的分辨率在100~200 nt左右，不能精准定位m6a，而芯片利用mazf酶，可在单碱基分辨率水平，准确检测m6aca位点。
• 定量m6a修饰：芯片可对m6aca位点进行定量，解决了检测m6a动态变化这个长期未得到满足的科研需求。• 样本需求量少：与merip-seq需要> 120 ug rna相比，芯片对总rna的要求量可低至1 ug，适用于稀有样本，珍贵病理样本，尤其是组织部位、低产量的筛选细胞以及小的动物模型等样本。
• 可靠的位点收集与系统性注释：arraystar建立了特殊的收集注释流程，对single-aca、poly-aca和cluster-aca上的可定量m6a位点进行了可靠收集和系统性注释。了解这些m6a位点的功能意义，
aksomics（原康成生物）是arraystar中国区唯一代理商，独家为您提供arraystar公司m6a单碱基分辨率芯片全程一站式技术服务。您只需要提供保存完好的组织或细胞标本，aksomics的芯片技术服务人员就可为您完成全部实验操作，并提供完整的实验报告。同时，根据您的研究需要，aksomics还提供各种深入数据挖掘服务。
arraystar m6a单碱基分辨率芯片产品列表
| 服务 | 芯片 | 规格 | 描述 |
| human m6a 单碱基分辨率芯片服务 | arraystar human m6a单碱基分辨率芯片 | 8×15k | 11,237个单一m6a位点; 3,084个多聚m6a位点; 693个成簇m6a位点 |
| mouse m6a单碱基分辨率芯片服务 | arraystar mouse m6a单碱基分辨率芯片 | 8×15k | 11,120个单一m6a位点; 3,199个多聚m6a位点; 279个成簇m6a位点 |
| rat m6a单碱基分辨率芯片服务 | arraystar rat m6a单碱基分辨率芯片 | 8×15k | 11,499个单一m6a位点; 3,082个多聚m6a位点; 2614个成簇m6a位点 |
rna酶mazf可识别单链rna上的aca序列，并在第一个a的5’端进行切割，而如果第一个a携带m6a修饰（即m6aca），则不能发生切割[5, 10]（图1）。对经过mazf酶处理，因具有m6aca序列而未被切割的rna片段，以及未经mazf酶处理的input rna，进行双色标记，然后与arraystar单碱基分辨率芯片杂交，从而得到单碱基分辨率水平的m6a定量值（图2）。该技术不依赖于半定量的m6a抗体免疫共沉淀技术，因此定量更加准确。
图 1. mazf 酶切割未甲基化的（aca）序列而不切割甲基化的（m6aca）序列。
arraystar单碱基分辨率芯片实验流程包括：
• 总rna片段化处理与dnase消化；
• mazf酶处理，切割未甲基化的（aca）序列而保留完成的甲基化（m6aca）序列。等份的未经mazf酶处理的rna作为input；
• 加入外参rna spike-ins，用作杂交信号校正；
• 分别合成crna，cy5（红光）标记mazf酶处理的样本，cy3（绿光）标记未经mazf酶处理的样本；
• 将两种荧光标记的crna混合，并与arraystar单碱基分辨率芯片杂交；
• 双色信号通道芯片数据分析与注释。
图2. arraystar单碱基分辨率芯片实验流程。
| arraystar m6a 单碱基分辨率芯片 | human | mouse | rat |
| 芯片规格 | 8 x 15k | 8 x 15k | 8 x 15k |
| 探针总数 | 14,321 | 14,319 | 14,581 |
| 探针长度 | 60nt | 60nt | 60nt |
| 单一m6aca 位点 | 11,237 | 11,120 | 11,499 |
| 多聚m6aca 位点 | 3,084 | 3,199 | 3,082 |
| 成簇m6aca 位点 | 693 | 279 | 2,614 |
| m6aca位点来源 | miclip dataset (linder et al., 2015; ke et al., 2015; xu et al., 2017; chen et al., 2015); rmbase database (schwartz et al., 2013) | miclip dataset (linder et al., 2015; ke et al., 2015; xu et al., 2017; chen et al., 2015); rmbase database (schwartz et al., 2013) | mouse m6aca site homologs (linder et al., 2015; ke et al., 2015; xu et al., 2017; chen et al., 2015); rmbase database (schwartz et al., 2013) |
m6a单碱基分辨率芯片结果提供丰而详细的生物信息学分析与注释，包括单碱基m6a化学计量、m6a定位、位点类型（single-, multiple-, clustered m6a位点）、转录本区域等等。它们是理解m6a动态变化、生物学功能、分子机制和疾病相关性的必要信息，是目前其它技术所无法提供的。
