tsrna(trf&tirna)测序

  • 简介
  • 服务特点
  • 结果展示
  •       trfs和tirnas是trna及其前体通过精确调控的加工过程产生的,作为小非编码rna行使多种生理功能,与诸多生理病理过程相关(图1)。据报道,trfs&tirnas能够以microrna的方式参与rna干扰;结合蛋白因子并调节目标mrna的稳定性;与细胞色素c互作,调控细胞凋亡;改变胚胎转录级联调控,作为父本表观遗传因子介导代谢疾病遗传;多种应激条件下促进应激颗粒的组装。

          trf&tirnas的组成和数量高度依赖于具体的细胞类型和病理状况,使得它们成为一类优质的生物标志物[1]。例如,trfs&tirn-as之间的比例关系能够作为癌症存活期指标和潜在的诊断标志物[2]。同时,相比其他microrna,trna和trfs&tirnas类群广泛富集于各种生物体液中[3-4]


     

    图1. trfs&tirnas功能及相关疾病

    aksomics(康成生物)trf&tirna测序服务提供从样品到数据的全套凯发app的解决方案。根据我们trf&tirna测序和表达谱分析中得到的丰富信息,按照中提供的方法及应用,科研工作者们能够更便捷地推进他们在这个新兴领域的研究工作。


    参考文献 

    1. telonis a.g. et al. (2015) "dissecting trna-derived fragment complexities using  personalized transcriptomes reveals novel fragment classes and unexpected dependencies." oncotarget 6(28):24797-822 [pmid: 26325506]

    2. olvedy m. et al. (2016) "a comprehensive repertoire of trna-derived fragments in prostate cancer." oncotarget [pmid: 27015120]

    3. schageman j. et al. (2013) "the complete exosome workflow solution: from isolation to characterization of rna cargo." biomed res int 2013:253957[pmid:24205503]

    4. dhahbi j.m. et al. (2013) "5' trna halves are present as abundant complexes in serum, concentrated in blood cells, and modulated by aging and calorie restriction." bmc genomics 14:298 [pmid: 23638709]



  • 1. 性能优化的测序方法与严格的质控过程
    2. 使用arraystar授权的"trf & tirna analysis system"
        •基于trna拓扑结构和统计显著性的精准注释与分类系统
        全面的trfs&tirnas数据库信息
        trfs&tirnas专注的生物信息学与统计学分析
    3. 额外的mirna表达和差异分析 
    4. 出版级的数据和图表展示 
    5. 无缝链接trna系列服务:trna-seq、trf&tirna pcr array和trna pcr array

  •        为了更好地了解trfs及tirnas的生物学特征,促进它们在生物标志物方面的应用,trf&tirna-seq提供了丰富的生物信息学分析。额外福利:其他microrna的表达分析也包含其中!
    1.表达及差异表达谱


     

    图2. 表达及差异分析数据表


    2.详尽的注释信息


     

     

    图3. 详尽注释的trf&tirna序列、家族、二级结构以及剪切位点


    3. trf&tirna在4种小rna类型中的分布

     

    图4. trf&tirna与其他相似尺寸小rna之间的相对含量关系,在多种组织中,trf&tirna的占较高甚至主要比例,这强烈预示了其重要的生理功能和生物标志物应用潜质。