转运rna（transfer ribonucleic acid，trna）是生物体内含量最为丰富的短链非编码rna分子。它携带并转运氨基酸，参与蛋白翻译，是连接mrna与蛋白质的重要桥梁。尽管trna广泛存在于生物体内，但不同机体基因组对于特定密码子的偏好性不同，从而导致trna表达谱的差异。密码子偏好性影响翻译效率和精确性[1-3]。因此，trna表达谱的改变对多种细胞生理过程有着显著影响。细胞增殖[4]、分化[4, 5]和凋亡[6]等一系列生命活动都伴随着trna水平的变化。另外，许多疾病也显示出trna水平和分布的紊乱。系列研究表明，trna谱的紊乱和肿瘤[5, 7-14]、ⅱ型糖尿病[15]、亨廷顿舞蹈症[16]、甲型h1n1流感[17]、天花[17]以及hiv感染[18]等疾病病理活动密切相关。因此，trna谱的研究对于深入了解人体生理及病理过程十分关键。
pcr芯片是研究特定类群基因最为可靠的手段。arraystar nrstar™ human trna repertoire pcr array包含66对细胞核trna引物和22对线粒体trna引物，覆盖了gtrnadb和trnadb两个数据库的所有反密码子信息。此芯片是研究人类trna谱方便有效的工具。
为了保证数据的可信度，pcr芯片采用3个短链非编码rna作为内参对照，使用rna spike-in对cdna合成和pcr效率进行评估。同时，芯片包含的基因组dna对照(genomic dna control，gdc)可以监控实验过程中基因组dna污染。另外，pcr阳性对照(positive pcr control, ppc)能够有效的评估pcr效率，并进行板间校正，消除不同批次芯片板之间的实验误差。
众所周知，trna具有大量种类繁多的转录后修饰，这些修饰对trna发挥功能起着关键作用。然而，这些修饰会严重影响trna cdna的合成质量。arraystar公司专门开发的trna反转录试剂盒(rtstar™ trna-optimized first-strand synthesis kit)，能够有效消除这些修饰对cdna合成的影响，极大提高trna cdna质量。与该试剂盒组合使用，研究人员能够获得更为真实的trna谱的变化状况，为研究蛋白质组或trna来源片段(trfs)提供重要信息。在后续研究中，敲低trna[19]或过表达trna [5, 20, 21]可以进一步揭示trna谱在细胞生命活动中的作用。其他用于研究非编码rna的相关技术也适用于trna的后续研究。
产品列表
| 产品名称 | 规格 | 描述 |
|---|---|---|
| nrstar™ human trna repertoire pcr array | 2 plate |
包含66对细胞核trna引物和22对线粒体trna引物 |
| nrstar™ human trna repertoire pcr array | 6 plate | |
| nrstar™ human trna repertoire pcr array | 12 plate |
适用实时定量荧光pcr仪：
abi viia™ 7, abi 7500 & abi 7500 fast, abi 7900ht, abi quantstudio™ 6 flex real-time pcr system, abi quantstudio™ 7 flex real-time pcr system, abi quantstudio™ 12k flex real-time pcr system, bio-rad cfx384, bio-rad icycler & iq real-time pcr systems, eppendorf realplex, qiagen rotor gene q 100, roche lightcycler 480, stratagene mx3000, roche lightcycler 480
康成使用arraystar的芯片为客户提供服务，以下为相关资料:
产品说明书：manual_nrstar™_human_trna_repertoire_pcr_array_v1.05
分析工具： analysis_tool_for_nrstar™_human_trna_repertoire_pcr_array_v1.0
分析工具说明书： instructions_of_human_trna_qpcr_data_analysis_tool
