nurna™ small rna biogenesis-related proteins pcr芯片

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    芯片

     规格

    描述

    nurna™ human small rnas biogenesis-related protein pcr array

    384-well(2*192)/ plate

    mirnas(57个) pirnas(17个) sirnas(24个) snornas(24个) snrnas(41个) trnas/trfs(47个)

           small rna是指长度小于200bp,不具蛋白编码能力的一类rna分子。small rnas不仅在细胞中具有较高的表达量,也广泛存在于各类体液中。根据长度、结构形态、功能形式以及合成途径的不同,科研人员将small rnas分成了七种类型:microrna (mirna)、piwi-interacting rna (pirna)、small interfering rna (sirna)、small nucleolar rna (snorna)、small nuclear rna (snrna)、transfer rna (trna)、trna-derived fragment (trf&tirna)(图1)。这些small rna分子在转录水平或转录后水平,参与调控基因表达[1-3]。

           small rna的合成途径极其复杂,具体过程有待进一步的挖掘。在许多疾病中,科研人员都检测到了不同small rna的合成紊乱。例如,drosha与dicer1是mirna合成过程中非常关键的两个蛋白,其表达水平会随着肿瘤的发生发展而变化,并可作为神经母细胞瘤预后诊断的潜在标记物[4]。近些年来,small rna吸引了越来越多的关注,small rna合成途径的研究也受到了更多的重视。

           对于特定通路或聚焦领域中的基因而言,pcr芯片是其表达研究最可靠便捷的手段。为了帮助研究人员方便快捷地分析small rna合成相关蛋白的表达水平,arraystar开发了市场上第一款small rna合成蛋白检测pcr芯片。该芯片能够同时分析185个mrna,它们都是在各类small rnas合成过程中发挥关键作用的蛋白分子的表达水平,是small rnas研究的一件利器。

    图 1. small rnas的分类与功能

    参考文献 

    [1] kim vn. small rnas: classification, biogenesis, and function. mol cells 19, 1-15. (2005),
    [2] esteller m. non-coding rnas in human disease. nat rev genet 12, 861-74. (2011), pmid:22094949.
    [3] matera ag, et al. non-coding rnas: lessons from the small nuclear and small nucleolar rnas. nat rev mol cell biol 8, 209-20. (2007), pmid:17318225.
    [4] lin rj, et al. microrna signature and expression of dicer and drosha can predict prognosis and delineate risk groups in neuroblastoma. cancer res 70, 7841-50. (2010), pmid:20805302.

  • 覆盖度广—收集了go通路中所有与small rna合成相关的蛋白分子
    严谨性强—所有引物都通过了多样本严格验证
    快速简易—即用型384孔板规格,只需将cdna与qpcr master mix混合试剂加入pcr板中,4小时内得到实验结果。cdna无需预先扩增。
  • 表1.人类small rnas合成相关蛋白(185个蛋白)

    mirna biogenesis (57):

    adar; ago1; ago2; ago3; ago4; bcdin3d; cnot1; cnot10; cnot11; cnot2; cnot3; cnot4; cnot6; cnot6l; cnot7; cnot8; dgcr8; dicer1; dis3l2; drosha; eif6; esr1; ets1; fosl1; hnrnpa2b1; hras; khsrp; lin28b; mettl14; mettl3; mov10; mrpl44; ncor1; ncor2; nfkb1; pnpt1; ppp3ca; prkra; ptbp1; ran; rbm4; rela; rpl7a; rqcd1; smad1; smad2; smad3; snip1; srrt; supv3l1; tarbp2; tnrc6a; tnrc6b; tnrc6c; xpo5; zc3h12a; zcchc11

    pirna biogenesis (17):

    asz1; ddx4; exd1; fkbp6; henmt1; mael; mov10l1; piwil1; piwil2; piwil4; pld6; tdrd1; tdrd12; tdrd6; tdrd7; tdrd9; tdrkh

    sirna biogenesis (24):

    adar; ago1; ago2; ago3; ago4; celf1; clp1; dicer1; drosha; mbd2; mbd3; mecp2; mrpl44; nrde2; prkra; tarbp2; tert; tlr7; tlr9; tsen15; tsen2; tsen34; tsen54; xpo5

    snorna biogenesis (24):

    aqr; dkc1; exosc2; exosc3; exosc4; exosc5; exosc6; fbl; fbll1; gar1; naf1; nop10; nop56; nop58; nudt16; pih1d1; prpf31; rnf113a; rnf113b; rpap3; ruvbl1; ruvbl2; snu13; znhit6

    snrna biogenesis (41):

    cpsf3l; dkc1; exosc2; exosc3; exosc4; exosc5; exosc6; exosc7; exosc8; exosc9; ints1; ints10; ints12; ints2; ints3; ints4; ints5; ints6; ints7; ints8; ints9; kpnb1; mepce; ncbp1; ncbp2; nhp2; nop10; phax; rpap2; smn1; snapc1; snapc2; snapc3; snapc4; snapc5; snupn; tgs1; tut1; usb1; xpo1; zpr1

    trna & trf biogenesis (47):

    ago1; ago2; ago3; ago4; ang; dgcr8; dicer1; eif2ak4; elac1; elac2; hsd17b10; kiaa0391; nup107; nup153; nup155; nup160; nup188; nup210; nup214; nup35; nup37; nup43; nup54; nup62; nup93; nup98; nupl2; piwil4; pom121c; pop1; pop4; pop5; pop7; ptcd1; rae1; ranbp2; rpp14; rpp21; rpp25; rpp30; rpp38; rpp40; tpr; trmt10c; trnt1; xpot; ybx1

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  • 康成使用arraystar的芯片为客户提供服务,以下为相关资料:

    产品说明书:manual_nurna™_human_small_rna_biogenesis_protein_pcr_array_v1.02

    分析工具: analysis tool for nurna™ human small rna biogenesis proteins pcr array_v1.0