靶向代谢组学

  • 简介
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  • 样品要求
  •        代谢组学技术 (metabolomics) 是后基因时代发展起来的系统生物学新技术,旨在测定生物体内所有小分析代谢产物。靶向代谢组学( targeted metabolomics)是代谢组学研究的重要组成部分,主要是以标准品为参照,对特定的代谢物群进行有针对性地、特异性地检测与分析。从定量角度来说,非靶向代谢组学主要检测样品中代谢物的相对含量,而靶向代谢组学更重要的是对代谢物在样品中的绝对含量进行测定。相对于全代谢组分析而言,靶向代谢组分析具有特异性强、检测灵敏度高和定量准确等特点。

           通过对血液、尿液或组织中特定代谢物的富集与准确定量定性分析,一方面可以结合蛋白质组学、转录组学和代谢组学数据揭示相关的分子生物学作用机制,获得更完整的生命图谱;另一方面,也可以为后续代谢分子标志物的深入研究和开发利用提供有力支持,并最终用于疾病机理研究、药物靶点发现及疾病诊断和治疗。

    图1.靶向代谢组学技术原理


           康成生物提供完全的靶向代谢组学检测分析服务。您只需要提供所需的生物样本,我们将为您完成从样品制备到数据分析的全部工作流程,并且提供玩完整的分析报告。


    参考文献

    1. zhou, j., et al., development and evaluation of a parallel reaction monitoring strategy for large-scale targeted metabolomics quantification. analytical chemistry, 2016. 88(8): p. 4478-4486.



  • 图2. 靶向代谢组学实验流程



  •        近几年来,随着分辨率和扫面速度的提升,高分辨质谱仪已经应用到不同疾病的代谢组学中,多种定性定量平台随之出现。juntuo zhou等人[1]使用orbitrap lc-ms系统,借助prm(parallel  reaction monitoring)的技术,开发了一种基于prm模式的大规模代谢组学定量方法。


           juntuozhou等人借助普通生物样品和临床样本评估了prm测定的动态范围、线性、重现性以及适用性。同时,还对基于q-exactive的prm和ms1的定量策略以及基于qtrap6500中的mrm定量策略进行了比较。结合skyline软件,通过prm鉴定到237种极性代谢物。相比于ms1定量具有更好的重现性和定量准确性,并且比基于qtrap 6500的mrm定量具有更大的灵活性。建立了一种可靠的prm方法,可用于大规模靶向代谢组学,为基础和临床代谢组学研究提供了新的选择。

    对比基于q-exactive的prm和ms1的定量策略和基于qtrap 6500中的mrm定量策略。



    通过2型糖尿病代谢表型(上)验证评估prm定量方法。





  •  验证非靶向代谢组学的实验结论

     分子机制研究

     疾病标志物的筛选



  • agilent hplc 1260     

    agilent qqq 6460




  • 样品类型

    样品要求

    血浆、尿液等体液样品

    血清、血浆、脑脊液>1ml,尿液>20ml

    细胞样品

    细胞量>2x107

    组织样品

    动物、微生物组织湿重 >100mg