nrstar™ human snorna pcr芯片

• 描述
• 芯片特点
• 工作流程
• 数据库
• 说明书

•        nrstar™ human snorna pcr array是目前市场上研究核仁小rna的最新最全的pcr芯片。此pcr芯片包含359个权威数据库来源的snorna，覆盖了所有pcr技术可区分的核仁小rna，是进行snorna表达检测与功能研究必不可少的工具。 

  产品列表

  产品名称	物种	规格	描述
  nrstar™ human snorna pcr array	human	1 plate	359条snorna、7条snorna靶向snrna以及4条snornp复合物成员mrna

       

         核仁小rna (snorna)是一类中等长度的非编码小rna，其长度60-400nt不等，与核仁核糖核蛋白结合形成snornps复合物发挥功能。在脊椎动物中，核仁小rna的编码基因主要存在于蛋白编码基因的内含子区，经转录加工处理形成成熟的核仁小rna分子。snorna参与多种生物学过程，比如rrna的加工处理，rna剪接和翻译，以及氧化应激反应的调控。snorna主要通过snornps复合物来发挥作用。通过snorna碱基互补识别靶基因特定位点，snornps复合物催化这些位点的2’-o甲基化或假尿嘧啶化反应。根据snorna结构与功能的不同，可以将snorna分为两大类：负责2’-o甲基化的box c/d snorna和负责假尿嘧啶化的box h/aca snorna。另外，还存在一类比较特殊的snorna- scarnas (它们具有类似box c、box d或者box h、box aca结构，特异表达于small cajal body)。snorna可以产生更小片段的非编码rna-sdrna。sdrna与mirna类似，能够通过调节mrna的稳定性来发挥作用。

         多项研究表明，snorna在肿瘤中异常表达，并在肿瘤的转移过程中扮演着重要角色。在乳腺癌和前列腺癌中，snord50a发生了2个碱基的缺失突变，并且其拷贝数明显降低，因此被认为是抑癌基因。有趣的是，h/aca box snorna snora42在肺癌中作为癌基因存在，抑制snora42的表达具有明显的抗癌作用。c/d box snornas的表达水平常伴随肿瘤的发生而增加。有一些c/d box snornas可以作为疾病的分子标志物，比如snord44和snord43与乳腺癌的不良预后相关。snorna在神经退行性疾病的发生发展过程也发挥着关键作用。snornas在血液、痰液以及尿液中稳定存在，使其作为疾病分子诊断标志物方面具有巨大的前景。目前，snorna已经成为疾病领域特别是癌症领域里的研究热点。
         nrstar™ human snorna pcr芯片包括359条snorna、7条snorna靶向snrna以及4条snornp复合物成员mrna。此pcr芯片覆盖了所有pcr技术可区分的snorna，能够快速方便的检测出组织、细胞以及血液中的snorna的表达情况。它还可应用于疾病分子标志物的高通量筛选和验证。
         为了确保数据质量，此芯片包含8个内参基因用于数据的均一化处理。此芯片还使用rna spike-in，pcc和gdc对照组来检测cdna合成效率，pcr扩增效率和基因组dna污染。

• ● 最佳覆盖范围覆盖—所有pcr技术可区分的snorna
  ● 无与伦比的灵敏度—只需50ng总rna，无需扩增
  ● 稳定有效的pcr引物—所有的snorna引物均在不同的细胞组织样本中通过严格验证
  ● 简单快速—只需将cdna与sybr® green master mix混合，加入板中，然后运行qpcr，4小时之内就能得到实验结果
  ● 疾病分子标志物筛选—适用于疾病分子标志物的高通量筛选和验证
  

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   图1. nrstar™ human snorna pcr array工作流程

  适用的定量pcr仪：
  abi viia™ 7，abi 7500 & abi 7500 fast，abi 7900ht，abi quantstudio™ 6 flex，real-time pcr system，abi quantstudio™ 7 flex real-time pcr system，abi quantstudio™ 12k flex real-time pcr system，bio-rad cfx384，bio-rad icycler & iq real-time pcr systems，eppendorf realplex，qiagen rotor gene q100，roche lightcycler480，stratagene mx3000，roche lightcycler480

• snopy：
  snorna-lbme-db：
  c/d box(213)
  snord4a; snord5; snord6; snord7; snord8; snord9; snord10; snord119; snord121a; snord121b; snord123; snord124; snord126; snord127; snord1a; snord1b; snord1c; snord2; snord101; snord102; snord103; snord103b; snord104; snord105; snord105b; snord12c; snord13; snord14a; snord14b; snord15a; snord15b; snord16; snord18a; snord18b; snord18c; snord20; snord21; snord22; snord24; snord25; snord26; snord27; snord28; snord3; snord30; snord31; snord32a; snord32b; snord33; snord34; snord35a; snord35b; snord36a; snord36b; snord36c; snord37; snord38a; snord38b; snord41; snord42a; snord42b; snord43; snord4b; u97; snord96b; snord96a; snord95; snord94; snord86; snord84; snord83b; snord83a; snord117; snord82; snord81; snord80; snord118; snord78; snord77; snord76; snord75; snord73a; snord63; snord62b; snord61; snord60; snord59b; snord59a; snord58b; snord58c; snord57; snord56; snord55; snord54; snord53; snord52; snord51; snord50; sord50b; snord48; snord47; snord46; snord45a; snord45b; snord45c; snord44; snord12; snord12b; snord112; snord113-1; snord114-1; snord17; snord19; snord19b; snord23; snord65; snord66; snord67; snord88a/b/c; snord68; snord69; snord70; snord71; snord72; snord85; snord87; snord90; snord91a; snord91b; snord92; snord93; snord98; snord99; snord100; snord109a/b; snord115-1; snord110; snord111; snord111b; snord116-1; snord11; snord11b; snord12; snord12b; snord113-2; snord113-4；snord113-5; snord113-6; snord113-7; snord113-8; snord113-9/ snord113-3; snord114-10/18; snord114-11; snord114-12/14; snord114-13; snord114-15/3/5/21/23/25/26; snord114-17/4; snord114-19; snord114-2; snord114-20/21/22/28; snord114-24; snord114-29/30; snord114-31; snord114-6/9; snord114-7; snord115-11; snord115-12; snord115-17/18/23; snord115-27/29/30; snord115-28; snord115-36; snord115-37; snord115-48; snord116-11; snord116-12/16/17/18/21/22/24; snord116-13/14/15/20; snord116-19; snord116-23; snord116-25/26; snord116-27/29/30; snord116-28; snord116-5; snord116-6; snord116-9; snord79; snord58a; snord49a; snord49b; snord45bl2; snord42bl1; snord3@l39; snord3@l19; snord118l14; snord3l3; snord118l11; snord68l1; snord118l9; snord3@l37; snord74l5; snord45bl1; snord65l2; snord23; snord38bl3; snord44l1; snord74l4; snord45bl3; snord56l7; snord77l3; snord41l1; snora25l14; snord75l2; snord114-15l1; u3.41-201; snord53l1; snord55l1; snord62bl1; snord51l1 

  h/aca box(122)
  snora10; snora13; snora14a; snora14b; snora15; snora16; snora17; snora18; snora19; snora21; snora22; snora23; snora24; snora25; snora28; snora3; snora2b; snora45; snora30; snora31; snora33; snora34; snora36; snora36b; snora37; snora38; snora39; snora4; snora41; snora42; snora43; snora44; snora46; snora48; snora49; snora5a; snora50; snora51; snora52; snora53; snora54; snora55; snora56; snora58; snora59; snora5b; snora5c; snora6; snora60; snora61; snora77; snora80; snora80b; snora7a; snora8; snora9; snora62; snora63; snora47; snora35; snora26; snora11b; snora11d; snora11e; snora36c; snora38b; snora84; snora11; snora12; snora73a; snora73b; snora74a; snora74b; snora64; snora65; snora66; snora67; snora70; snora70b; snora70c; snora70d; snora70e; snora70f; snora71a; snora71b; snora72; snora99; snora71d; snora20; snora27; snora29; snora32; snora40; snora78; hbi-61; snora11c; snora68; snora69; snora16b; snora1; snora72l7; snora64l2; snora18l1; snora62l2; al137790.4; snora11dl1; snora51l11; snora10l1; snora12l2; snora11el1; snora70bl6; snora20l1; snora63l9; snora18l2; snora20l4; snora11bl2; snora67l1; snora32l2; snora2al1; snora43l2; snora12l1; snora62l4

  cajal body-specific scarnas(24)
  scarna18; htr; hbii-382; scarna13; scarna8; scarna17; scarna7; scarna12; scarna6; scarna5; scarna10; scarna14; mgu2-25/61; scarna9; mgu12-22/u4-8; hbi-100; aca68; aca66; scarna11; scarna16; scarna1; scarna4; scarna23; scarna22

• 康成使用arraystar的芯片为客户提供服务，以下为相关资料:

  产品说明书：   manual_nrstar™_human_snorna_pcr_array_v1.01

  分析工具： analysis tool for nrstar™ human snorna pcr array

  分析工具说明书： instructions of snorna qpcr data analysis tool