mrna碱基修饰检测

• 简介
• 分析种类
• 结果展示

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  mrna化学修饰的定量检测是表观转录组学研究所必不可少的环节。检测不同处理条件下的表观转录修饰变化将为下一步的研究提供重要线索。aksomics（原康成生物）的质谱检测平台能够为客户提供全面而准确的mrna修饰谱。利用agilent质谱仪，检测36种修饰碱基在各个样品中的修饰丰度。

  
  

  
  

  服务特色：

  ● 优化的前期处理与agilent优质设备 

  ● 全面而准确的碱基修饰分析

  
  

  分析流程：

  

  图释：lc-ms mrna修饰检测服务流程图。

  
  

• number	nucleoside	symbol	number	nucleoside	symbol
  01	3′-o-methyladenosine	3′-omea	19	1-methylguanosine	m1g
  02	2′-o-methylcytidine	cm	20	7-methylguanosine	m7g
  03	5-methylcytidine	m5c	21	n2-methylguanosine	m2g
  04	n6-isopentenyladenosine	i6a	22	3′-o-methylinosine	3′-omei
  05	5,2′-o-dimethylcytidine	m5cm	23	2-thiouridine	s2u
  06	1-methyladenosine	m1a	24	4-thiouridine	s4u
  07	2-thiocytidine	s2c	25	5-methyluridine	m5u
  08	n2,n2,7-trimethylguanosine	m2,2,7g	26	n4-acetylcytidine	ac4c
  09	n4-acetyl-2′-o-methylcytidine	ac4cm	27	3′-o-methyluridine	3′-omeu
  10	n6-methyladenosine	m6a	28	5-methyl-2-thiouridine	m5s2u
  11	3-methylcytidine	m3c	29	5-methoxyuridine	mo5u
  12	3′-o-methylcytidine	3′-omec	30	pseudouridine	ψ
  13	2′-o-methyladenosine	am	31	2′-o-methylinosine	im
  14	n2,n2-dimethylguanosine	m22g	32	3-methyluridine	m3u
  15	5′-o-methylthymidine	5′-omet	33	3′-o-methylguanosine	3′-omeg
  16	2′-o-methyluridine	um	34	1-methylpseudouridine	m1ψ
  17	inosine	i	35	5-hydroxymethylcytidine	hm5c
  18	2′-o-methylguanosine	gm	36	5,2′-o-dimethyluridine	m5um

• 1. 修饰定量分析

  

  图释：mrna修饰数量分析图。

  
  

  2. 总离子流程图

  

  图释：总离子流程图

  
  

  3. 不同离子对合并peak图

         优化的前期处理与agilent优质设备，确保了各修饰碱基之间具有很好的区分度。

  

  图释：不同离子对合并peak图。

  
  

  4. 差异性mrna修饰

        对不同样本间的修饰丰度进行比较分析，发现具有差异修饰的核苷酸。这些修饰的差异可能导致mrna在成熟、稳定性以及翻译等方面明显的差异。

  
  

  

  图释：mrna修饰heatmap图。