small rna修饰——2021研究热点,大有可为

small rna分子上存在着多种不同的修饰,如5-甲基胞嘧啶(m5c),7-甲基鸟嘌呤(m7g),8-氧代鸟嘌呤(o8g),假尿嘧啶(ψ)和n6-甲基腺嘌呤(m6a)等。已有研究表明,small rna上的修饰可以影响mirna生成、mirna识别靶基因和small rna的稳定性等,也可作为区分自身和外源rna的标记,同时还具有优良的诊断疾病与判断患者预后的潜力,有望成为一类新的生物标志物。


nature重磅发布:small rna修饰在疾病发生中的重要作用

mir-1特异性位点的o8g修饰诱导心肌肥大

肾上腺素受体在受到激活后会产生ros(活性氧)并导致mir-1 种子区(位置2-8)的o8g修饰,该修饰改变了原本g与c的配对,变为与腺嘌呤(a)配对,导致了mir-1靶向的mrna发生变化,最终诱导产生心肌肥大。该研究揭示了mirna上特定位点的o8g修饰作为表观转录修饰扮演着重要的基因调控作用。



seok, heeyoung, et al. "position-specific oxidation of mir-1 encodes cardiac hypertrophy." nature 584.7820 (2020): 279-285.


arraystar small rna修饰芯片新品发布!

arraystar small rna修饰芯片可在单次实验中同时定量mirna,pre-mirna和trna衍生的small rna(tsrna,包括trf&tirna)的一种碱基修饰。可检测的修饰包括:8-氧代鸟嘌呤(o8g),7-甲基鸟嘌呤(m7g),n6-甲基腺嘌呤(m6a),假尿嘧啶(ψ)和5-甲基胞嘧啶(m5c)。


arraystar small rna修饰芯片优势

• 金标准准确定量small rna的修饰:直接rna末端标记,避免了测序建库过程中因修饰导致的cdna延伸中止的情况,可确保对small rna修饰定量的高保真性。

• 高灵敏度检测低水平small rna的修饰: 克服二代测序的局限性,对低表达或低修饰水平的small rna分析具有出色的分析灵敏度。

• 所需样品量少,总rna量可低至1 µg。


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