|
基因芯片技术服务 small rna修饰芯片 m6a单碱基分辨率芯片 mrna&lncrna表观转录组芯片 circrna表观转录组芯片 |
ngs测序技术服务 rna m6a甲基化测序（merip seq） |
lc-ms mrna碱基修饰检测 trna碱基修饰检测 |
pcr技术服务 m6a绝对定量rt-pcr技术服务 m6a单碱基位点pcr（mazf酶切法）技术服务 |
|
基因芯片技术服务 dna甲基化芯片 dna羟甲基化芯片 chip-chip |
ngs测序技术服务 dna甲酰基胞嘧啶(5fc)修饰测序 dna 5hmc 测序（化学法） dna甲基化测序 dna羟甲基化测序 染色质免疫共沉淀测序 |
pcr技术服务 medip-qpcr hmedip-qpcr chip-qpcr |
|
蛋白相对定量 tmt标记定量技术 非标定量技术 |
蛋白修饰 tmt标记定量磷酸化 非标定量磷酸化 |
rna/蛋白-蛋白相互作用 rna-蛋白相互作用 蛋白-蛋白相互作用 |
第二军医大学孙树汉教授课题组长期致力于肝癌的研究。其课题组使用arraystar lncrna芯片研究肝癌，连续发表了6篇sci文章，其中4篇发表在hepatology；近期，其课题组的研究成员发现了能抑制肝癌转移的新分子：lncrna-let，该研究成果刊登在molecular cell上。（ lncrna芯片实验均由康成提供技术服务）
研究背景
缺氧环境对肝癌，结肠癌，肺鳞癌的转移发挥关键作用。近来的研究发现lncrna在多种肿瘤中异常表达并调控肿瘤的转移，但是，对于肿瘤中lncrna表达调控的分子机制仍不清楚。孙树汉教授课题组本次研究目的在于揭示缺氧，lncrna表达，肿瘤转移之间的关联。
研究思路
研究者应用美国arraystar公司的human lncrna芯片对5例肝癌组织和5例癌旁组织的lncrna表达谱进行了比较，其中lncrna-let在肝癌组织中特异性低表达。并且验证发现lncrna-let在肝癌，结肠癌和肺鳞癌组织中的表达均显著下调，因此选择此lncrna作为研究对象。
对lncrna-let的功能研究发现，在缺氧条件下，lncrna-let能够抑制肝癌细胞的转移；进一步的机制研究表明在肝癌细胞中，缺氧条件促进组蛋白脱乙酰酶3 (hadc3)表达上调，引起结合在lncrna-let启动子区的组蛋白乙酰化减少，从而抑制lncrna-let的表达，lncrna-let的低表达导致hif-1a表达增多，最终促进肝癌细胞转移。
为了在临床验证lncrna-let的表达与乙酰化的关系，研究者对12例肝癌组织和对应癌旁组织检测发现，在肝癌组织中lncrna-let启动子区组蛋白乙酰化水平明显减少；并且相对于非转移性肝癌组织，lncrna-let在转移性肝癌组织样本中表达水平显著下调。
研究意义
该研究将缺氧，lncrna低表达，肝癌细胞转移关联在一起，系统阐述了在缺氧条件下lncrna的表达调控机制和lncrna对肿瘤细胞转移的调控机制，这为肿瘤治疗提供了新的方向和靶点。
原文出处
repression of the long noncoding rna-let by histone deacetylase 3 contributes to hypoxia-mediated metastasis. molecular cell. 2013.
