nrstar™ human snorna pcr array是目前市场上研究核仁小rna的最新最全的pcr芯片。此pcr芯片包含359个权威数据库来源的snorna,覆盖了所有pcr技术可区分的核仁小rna,是进行snorna表达检测与功能研究必不可少的工具。
产品列表
产品名称 |
物种 |
规格 |
描述 |
nrstar™ human snorna pcr array |
human |
1 plate |
359条snorna、7条snorna靶向snrna以及4条snornp复合物成员mrna |
核仁小rna (snorna)是一类中等长度的非编码小rna,其长度60-400nt不等,与核仁核糖核蛋白结合形成snornps复合物发挥功能。在脊椎动物中,核仁小rna的编码基因主要存在于蛋白编码基因的内含子区,经转录加工处理形成成熟的核仁小rna分子。snorna参与多种生物学过程,比如rrna的加工处理,rna剪接和翻译,以及氧化应激反应的调控。snorna主要通过snornps复合物来发挥作用。通过snorna碱基互补识别靶基因特定位点,snornps复合物催化这些位点的2’-o甲基化或假尿嘧啶化反应。根据snorna结构与功能的不同,可以将snorna分为两大类:负责2’-o甲基化的box c/d snorna和负责假尿嘧啶化的box h/aca snorna。另外,还存在一类比较特殊的snorna- scarnas (它们具有类似box c、box d或者box h、box aca结构,特异表达于small cajal body)。snorna可以产生更小片段的非编码rna-sdrna。sdrna与mirna类似,能够通过调节mrna的稳定性来发挥作用。
多项研究表明,snorna在肿瘤中异常表达,并在肿瘤的转移过程中扮演着重要角色。在乳腺癌和前列腺癌中,snord50a发生了2个碱基的缺失突变,并且其拷贝数明显降低,因此被认为是抑癌基因。有趣的是,h/aca box snorna snora42在肺癌中作为癌基因存在,抑制snora42的表达具有明显的抗癌作用。c/d box snornas的表达水平常伴随肿瘤的发生而增加。有一些c/d box snornas可以作为疾病的分子标志物,比如snord44和snord43与乳腺癌的不良预后相关。snorna在神经退行性疾病的发生发展过程也发挥着关键作用。snornas在血液、痰液以及尿液中稳定存在,使其作为疾病分子诊断标志物方面具有巨大的前景。目前,snorna已经成为疾病领域特别是癌症领域里的研究热点。
nrstar™ human snorna pcr芯片包括359条snorna、7条snorna靶向snrna以及4条snornp复合物成员mrna。此pcr芯片覆盖了所有pcr技术可区分的snorna,能够快速方便的检测出组织、细胞以及血液中的snorna的表达情况。它还可应用于疾病分子标志物的高通量筛选和验证。
为了确保数据质量,此芯片包含8个内参基因用于数据的均一化处理。此芯片还使用rna spike-in,pcc和gdc对照组来检测cdna合成效率,pcr扩增效率和基因组dna污染。
图1. nrstar™ human snorna pcr array工作流程
适用的定量pcr仪:
abi viia™ 7,abi 7500 & abi 7500 fast,abi 7900ht,abi quantstudio™ 6 flex,real-time pcr system,abi quantstudio™ 7 flex real-time pcr system,abi quantstudio™ 12k flex real-time pcr system,bio-rad cfx384,bio-rad icycler & iq real-time pcr systems,eppendorf realplex,qiagen rotor gene q100,roche lightcycler480,stratagene mx3000,roche lightcycler480
h/aca box(122)
snora10; snora13; snora14a; snora14b; snora15; snora16; snora17; snora18; snora19; snora21; snora22; snora23; snora24; snora25; snora28; snora3; snora2b; snora45; snora30; snora31; snora33; snora34; snora36; snora36b; snora37; snora38; snora39; snora4; snora41; snora42; snora43; snora44; snora46; snora48; snora49; snora5a; snora50; snora51; snora52; snora53; snora54; snora55; snora56; snora58; snora59; snora5b; snora5c; snora6; snora60; snora61; snora77; snora80; snora80b; snora7a; snora8; snora9; snora62; snora63; snora47; snora35; snora26; snora11b; snora11d; snora11e; snora36c; snora38b; snora84; snora11; snora12; snora73a; snora73b; snora74a; snora74b; snora64; snora65; snora66; snora67; snora70; snora70b; snora70c; snora70d; snora70e; snora70f; snora71a; snora71b; snora72; snora99; snora71d; snora20; snora27; snora29; snora32; snora40; snora78; hbi-61; snora11c; snora68; snora69; snora16b; snora1; snora72l7; snora64l2; snora18l1; snora62l2; al137790.4; snora11dl1; snora51l11; snora10l1; snora12l2; snora11el1; snora70bl6; snora20l1; snora63l9; snora18l2; snora20l4; snora11bl2; snora67l1; snora32l2; snora2al1; snora43l2; snora12l1; snora62l4
cajal body-specific scarnas(24)
scarna18; htr; hbii-382; scarna13; scarna8; scarna17; scarna7; scarna12; scarna6; scarna5; scarna10; scarna14; mgu2-25/61; scarna9; mgu12-22/u4-8; hbi-100; aca68; aca66; scarna11; scarna16; scarna1; scarna4; scarna23; scarna22
康成使用arraystar的芯片为客户提供服务,以下为相关资料:
产品说明书: manual_nrstar™_human_snorna_pcr_array_v1.01
分析工具: analysis tool for nrstar™ human snorna pcr array
分析工具说明书: instructions of snorna qpcr data analysis tool